（一）辦公室（電子數據審計科）

負責擬訂工作制度、年度工作計劃、工作總結等；承擔督查督辦、考核等工作；負責財務和資產管理工作；負責對外聯系、宣傳、接待等工作；負責組織人事、干部教育、離退休干部服務管理等工作；負責機關黨建、黨風廉政建設、群團、信訪辦理等工作；負責文電、會務、保密、檔案、車輛、應急、安全等日常工作；負責審計項目實施所需的各類業務、財務、管理等電子數據的歸集、整理、儲存；負責審計信息系統建設、管理、維護；組織開展相關審計數據分析；負責計算機審計技術的支持和培訓；負責信息系統和電子數據的安全保密管理與檢查；承辦領導交辦的其他工作。

（二）法規審理科

負責對審計項目實施情況進行督促檢查，對審計項目實施質量進行管理督查，對業務部門提交的審計方案、審計結果文書以及相關資料進行審查；負責起草本單位審計業務管理制度，承擔與審計業務有關規范性文件的合法性審核；承辦審計聽證、行政訴訟、行政復議；開展法制宣傳教育；承辦領導交辦的其他工作。

（三）整改督查與內審管理科

負責審計規劃及年度審計項目計劃的編制和執行的督查，承擔審計項目實施情況的統計工作；負責統籌協調、辦理審計（調查）結果對外公告工作；負責被審計單位、有關部門落實審計整改的督查工作；負責審計移交線索辦理情況的協調督促工作；負責起草向本級人大常委會、政府和市審計局報送的審計結果報告、審計工作報告及審計整改情況報告；負責對屬于審計監督對象的單位的內部審計工作進行業務指導和監督；負責核查社會審計機構對依法屬于審計監督對象的單位出具的相關審計報告；負責指導和監督國有和國有資本占控股或主導地位的企業的監事會工作；承辦領導交辦的其他工作。

（四）重大政策執行審計科

負責對國家和市委、市政府有關重大政策措施貫徹落實情況的審計；國家和市委、市政府投資政策貫徹執行情況的審計，承擔對縣屬重點行業建設規劃、投資計劃執行和縣屬重大公共投資建設項目實施過程的審計監督；承辦領導交辦的其他工作。

（五）財政審計科

負責對本級預算執行情況和其他財政收支、本級決算（草案）編制情況進行審計；負責對本級各部門和下級政府預算執行情況、決算以及其他財政收支情況進行審計；負責對縣級管理的社會保障資金、涉農資金、社會捐贈資金以及其他有關基金、資金的財務收支進行審計；受托對國際組織和外國政府援助、貸款項目資金進行審計；負責對財政收支有關事項進行專項審計調查；承辦領導交辦的其他工作。。

（六）企事業審計科

負責對縣屬國有和國有資本占控股或主導地位的企業資產、負債、損益進行審計監督；對國有企業有關事項進行專項審計調查；負責對教育、衛生健康、文化體育、民政、環保等專項資金的審計監督；負責對使用財政資金的縣屬事業單位和社會團體的財務收支進行審計；承擔自然資源資產管理、污染防治和生態保護與修復情況審計；承辦領導交辦的其他工作。

（七）投資審計科

負責對縣政府投資和以縣政府投資為主的建設項目的預算或者概算的執行情況、工程結算、項目竣工決算進行審計；承辦領導交辦的其他工作。

（八）經濟責任審計科（云陽縣經濟責任審計工作聯席會議辦公室）

負責經濟責任審計工作聯席會議的具體工作；負責對黨政主要領導干部和國有企業領導人員實施經濟責任審計；負責對機構設置、編制使用和城鄉規劃等執行情況進行審計；負責領導干部自然資源資產離任審計；承辦領導交辦的其他工作。